Screening di idrogel per proprietà antifibrotiche impiantando alginati cellulari con codice a barre nei topi e non

Nature Biomedical Engineering volume 7, pagine 867–886 (2023) Citare questo articolo

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Lo screening delle proprietà antifibrotiche dei biomateriali impiantabili è limitato dalla necessità di test in vivo. Qui mostriamo che la produttività dello screening in vivo può essere aumentata mediante codifica a barre cellulare di una libreria combinatoria chimicamente modificata di formulazioni di idrogel. Il metodo prevede l'impianto di una miscela di formulazioni di alginato, ciascuna codificata a barre con cellule endoteliali della vena ombelicale umana provenienti da diversi donatori, e l'associazione dell'identità e delle prestazioni di ciascuna formulazione mediante la genotipizzazione dei polimorfismi a singolo nucleotide delle cellule tramite sequenziamento di prossima generazione. Abbiamo utilizzato il metodo per selezionare 20 formulazioni di alginato in un singolo topo e 100 formulazioni di alginato in un singolo primate non umano e identificato tre formulazioni di idrogel di piombo con proprietà antifibrotiche. L’incapsulamento di isole umane con una delle formulazioni ha portato al controllo glicemico a lungo termine in un modello murino di diabete, mentre il rivestimento di cateteri di grado medico con le altre due formulazioni ha impedito la crescita eccessiva fibrotica. Lo screening ad alto rendimento di biomateriali con codice a barre in vivo può aiutare a identificare formulazioni che migliorano le prestazioni a lungo termine dei dispositivi medici e delle cellule terapeutiche incapsulate nel biomateriale.

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I principali dati a supporto dei risultati di questo studio sono disponibili all'interno del documento e delle sue informazioni supplementari. È possibile accedere ai dati grezzi di sequenziamento generati in questo studio tramite Figshare all'indirizzo https://figshare.com/projects/In_vivo_screening_of_idrogel_library_using_cellular_barcoding_identifying_biomaterials_that_mitigate_host_immune_responses_and_fibrosis/144375. I set di dati generati e analizzati durante lo studio sono disponibili per scopi di ricerca presso gli autori corrispondenti su richiesta ragionevole.

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80% regardless of low DNA input (<1 ng) in the starting material./p>50; and 2) overall log-likelihood higher than -200, and 3) goodness measurement higher than 10 where goodness is defined as the difference of log-likelihood between the most likely and the second most likely donor pairs). The material corresponding to the identified donor cell or cell composition would be the material encapsulating cells./p>